Jonathan Kooman volgde zijn eerste orgellessen bij Jos Vogel. Hij studeerde hoofdvak orgel bij Bram Beekman en Henco de Berg en bijvak piano bij Frans van der Tak aan het Brabants Conservatorium in Tilburg (Fontys). Hij behaalde zijn Bachelor- en Masterdiploma’s. Tijdens en na zijn studie volgde hij interpretatielessen en masterclasses bij onder andere Bernard Bartelink, Peter van Dijk, Ben van Oosten, Ad van Sleuwen en Bas de Vroome.

2018 – hedenKerkmusicus Protestantse Gemeente te Wageningen (De Graaf, 1961, II/P en Flentrop, 1955, III/P)
2011 – hedenBegeleider Tiels Vocaal Ensemble
2008 – hedenBestuurslid Commissie Orgelconcerten St. Maartenskerk Tiel
2006 – hedenOrganist St. Maartenskerk Tiel (Bätz-Witte, 1854, II/P)
2017 – 2018Organist a.i. De Open Hof, Soest (Nijsse, 1997, II/P)
2016 – 2018Organist a.i. Hooglandse Kerk Leiden (De Swart/Van Hagerbeer, 1565, II/P)
2007 – 2017Repetitor en continuo-speler Cantatekoor Bilthoven (Projectkoor Midden Nederland)
2004 – 2016Organist Gereformeerde Kerk (Schaepmanstraat) Tiel (Flentrop, 1951, II/P)
2004 – 2008Organist Hervormde Kerk Ochten (J. de Koff & Zn, 1953, II/P)
1999 – 2010Continuo-speler Scratch Messiah Vlissingen
1999 – 2004Organist Engelse Kerk Middelburg (Stevens, 1761, I/P aangehangen)
1998 – 2004Organist Ontmoetingskerk Middelburg (Van Vulpen, 1972, II/P)
1995 – 2000Organist Hervormde Kerk Veere (Lindsen, 1855, II/P)
1994 – 2002Organist Verpleeghuis Der Boede te Koudekerke (De Koff 1970, I)